Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLE4Q04727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLE4Q04727 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLE4Q04727 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLE4Q04727 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLE4Q04727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLE4Q04727 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLE4Q04727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLE4Q04727 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLE4Q04727 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLE4Q04727 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLE4Q04727 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TLE4Q04727 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLE4Q04727 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLE4Q04727 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLE4Q04727 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLE4Q04727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLE4Q04727 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLE4Q04727 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLE4Q04727 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLE4Q04727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TLE4Q04727 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLE4Q04727 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLE4Q04727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLE4Q04727 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLE4Q04727 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLE4Q04727 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLE4Q04727 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms