Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL18AQ02543 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL18AQ02543 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL18AQ02543 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL18AQ02543 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL18AQ02543 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL18AQ02543 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms