Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1DQ01668 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1DQ01668 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1DQ01668 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1DQ01668 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1DQ01668 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1DQ01668 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1DQ01668 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1DQ01668 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1DQ01668 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1DQ01668 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1DQ01668 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1DQ01668 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1DQ01668 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1DQ01668 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1DQ01668 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1DQ01668 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1DQ01668 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1DQ01668 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1DQ01668 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA1DQ01668 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1DQ01668 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1DQ01668 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1DQ01668 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1DQ01668 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1DQ01668 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1DQ01668 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms