Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HTRA4P83105 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HTRA4P83105 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HTRA4P83105 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HTRA4P83105 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HTRA4P83105 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HTRA4P83105 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HTRA4P83105 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HTRA4P83105 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HTRA4P83105 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HTRA4P83105 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HTRA4P83105 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HTRA4P83105 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HTRA4P83105 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HTRA4P83105 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HTRA4P83105 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTRA4P83105 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HTRA4P83105 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HTRA4P83105 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HTRA4P83105 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HTRA4P83105 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HTRA4P83105 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HTRA4P83105 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HTRA4P83105 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTRA4P83105 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HTRA4P83105 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HTRA4P83105 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTRA4P83105 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HTRA4P83105 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTRA4P83105 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTRA4P83105 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTRA4P83105 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms