Protein–RNA interactions for Protein: P82912

MRPS11, 28S ribosomal protein S11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS11P82912 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPS11P82912 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPS11P82912 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPS11P82912 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS11P82912 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS11P82912 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS11P82912 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS11P82912 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS11P82912 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS11P82912 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS11P82912 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS11P82912 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS11P82912 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPS11P82912 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS11P82912 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS11P82912 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms