Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIM1P81133 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIM1P81133 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIM1P81133 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIM1P81133 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIM1P81133 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIM1P81133 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIM1P81133 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIM1P81133 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SIM1P81133 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIM1P81133 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIM1P81133 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SIM1P81133 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIM1P81133 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIM1P81133 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIM1P81133 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SIM1P81133 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIM1P81133 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIM1P81133 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIM1P81133 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIM1P81133 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIM1P81133 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIM1P81133 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIM1P81133 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIM1P81133 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIM1P81133 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIM1P81133 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SIM1P81133 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIM1P81133 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIM1P81133 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SIM1P81133 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIM1P81133 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIM1P81133 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIM1P81133 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIM1P81133 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIM1P81133 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SIM1P81133 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIM1P81133 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIM1P81133 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIM1P81133 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SIM1P81133 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIM1P81133 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIM1P81133 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIM1P81133 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIM1P81133 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIM1P81133 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIM1P81133 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SIM1P81133 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIM1P81133 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIM1P81133 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIM1P81133 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIM1P81133 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIM1P81133 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIM1P81133 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIM1P81133 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIM1P81133 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIM1P81133 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIM1P81133 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SIM1P81133 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIM1P81133 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIM1P81133 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIM1P81133 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIM1P81133 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIM1P81133 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIM1P81133 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIM1P81133 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIM1P81133 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIM1P81133 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIM1P81133 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIM1P81133 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIM1P81133 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIM1P81133 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SIM1P81133 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SIM1P81133 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIM1P81133 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIM1P81133 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIM1P81133 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIM1P81133 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIM1P81133 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIM1P81133 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIM1P81133 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIM1P81133 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIM1P81133 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIM1P81133 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIM1P81133 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SIM1P81133 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIM1P81133 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIM1P81133 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIM1P81133 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIM1P81133 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIM1P81133 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIM1P81133 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIM1P81133 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIM1P81133 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIM1P81133 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIM1P81133 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIM1P81133 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIM1P81133 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM1P81133 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM1P81133 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms