Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARPC4P59998 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARPC4P59998 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARPC4P59998 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARPC4P59998 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARPC4P59998 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC4P59998 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARPC4P59998 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARPC4P59998 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4P59998 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4P59998 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4P59998 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4P59998 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARPC4P59998 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARPC4P59998 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.9 ms