Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH11P55287 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH11P55287 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH11P55287 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH11P55287 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH11P55287 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH11P55287 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH11P55287 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH11P55287 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH11P55287 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH11P55287 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH11P55287 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH11P55287 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH11P55287 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH11P55287 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH11P55287 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH11P55287 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH11P55287 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH11P55287 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH11P55287 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH11P55287 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH11P55287 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH11P55287 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH11P55287 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH11P55287 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH11P55287 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH11P55287 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH11P55287 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH11P55287 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH11P55287 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH11P55287 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH11P55287 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH11P55287 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH11P55287 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH11P55287 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH11P55287 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH11P55287 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH11P55287 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH11P55287 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH11P55287 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH11P55287 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH11P55287 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH11P55287 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH11P55287 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH11P55287 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH11P55287 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH11P55287 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH11P55287 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH11P55287 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH11P55287 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH11P55287 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH11P55287 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH11P55287 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH11P55287 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH11P55287 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH11P55287 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH11P55287 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH11P55287 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH11P55287 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH11P55287 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH11P55287 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH11P55287 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH11P55287 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH11P55287 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH11P55287 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH11P55287 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH11P55287 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH11P55287 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH11P55287 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH11P55287 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH11P55287 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH11P55287 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH11P55287 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH11P55287 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH11P55287 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH11P55287 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH11P55287 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH11P55287 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH11P55287 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH11P55287 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH11P55287 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH11P55287 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH11P55287 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH11P55287 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH11P55287 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH11P55287 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH11P55287 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH11P55287 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH11P55287 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH11P55287 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH11P55287 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH11P55287 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH11P55287 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH11P55287 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH11P55287 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH11P55287 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH11P55287 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH11P55287 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH11P55287 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH11P55287 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms