Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELLP55199 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELLP55199 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELLP55199 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELLP55199 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELLP55199 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELLP55199 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELLP55199 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELLP55199 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELLP55199 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELLP55199 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELLP55199 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ELLP55199 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELLP55199 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELLP55199 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELLP55199 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELLP55199 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELLP55199 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELLP55199 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELLP55199 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELLP55199 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELLP55199 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELLP55199 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELLP55199 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELLP55199 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELLP55199 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELLP55199 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELLP55199 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELLP55199 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELLP55199 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELLP55199 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELLP55199 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELLP55199 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELLP55199 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELLP55199 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELLP55199 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELLP55199 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ELLP55199 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELLP55199 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELLP55199 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELLP55199 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELLP55199 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELLP55199 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ELLP55199 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELLP55199 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELLP55199 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELLP55199 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELLP55199 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELLP55199 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELLP55199 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELLP55199 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELLP55199 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELLP55199 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELLP55199 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELLP55199 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELLP55199 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELLP55199 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELLP55199 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELLP55199 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELLP55199 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELLP55199 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELLP55199 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELLP55199 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELLP55199 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELLP55199 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELLP55199 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELLP55199 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELLP55199 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ELLP55199 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELLP55199 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELLP55199 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELLP55199 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELLP55199 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELLP55199 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELLP55199 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELLP55199 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELLP55199 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELLP55199 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELLP55199 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELLP55199 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELLP55199 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELLP55199 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELLP55199 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ELLP55199 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ELLP55199 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELLP55199 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELLP55199 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELLP55199 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELLP55199 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELLP55199 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELLP55199 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELLP55199 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELLP55199 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELLP55199 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELLP55199 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELLP55199 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELLP55199 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELLP55199 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELLP55199 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELLP55199 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms