Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
AFDNP55196 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
AFDNP55196 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
AFDNP55196 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
AFDNP55196 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
AFDNP55196 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
AFDNP55196 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
AFDNP55196 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
AFDNP55196 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
AFDNP55196 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
AFDNP55196 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
AFDNP55196 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
AFDNP55196 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
AFDNP55196 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
AFDNP55196 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
AFDNP55196 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
AFDNP55196 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
AFDNP55196 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
AFDNP55196 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
AFDNP55196 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
AFDNP55196 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
AFDNP55196 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
AFDNP55196 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
AFDNP55196 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
AFDNP55196 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
AFDNP55196 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
AFDNP55196 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
AFDNP55196 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
AFDNP55196 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
AFDNP55196 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
AFDNP55196 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
AFDNP55196 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
AFDNP55196 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
AFDNP55196 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
AFDNP55196 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
AFDNP55196 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
AFDNP55196 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
AFDNP55196 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
AFDNP55196 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
AFDNP55196 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
AFDNP55196 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
AFDNP55196 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
AFDNP55196 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
AFDNP55196 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
AFDNP55196 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
AFDNP55196 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
AFDNP55196 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
AFDNP55196 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
AFDNP55196 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
AFDNP55196 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
AFDNP55196 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
AFDNP55196 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
AFDNP55196 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
AFDNP55196 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
AFDNP55196 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
AFDNP55196 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
AFDNP55196 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
AFDNP55196 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
AFDNP55196 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
AFDNP55196 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
AFDNP55196 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
AFDNP55196 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
AFDNP55196 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
AFDNP55196 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
AFDNP55196 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
AFDNP55196 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
AFDNP55196 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
AFDNP55196 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
AFDNP55196 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
AFDNP55196 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
AFDNP55196 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
AFDNP55196 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
AFDNP55196 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
AFDNP55196 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
AFDNP55196 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
AFDNP55196 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
AFDNP55196 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AFDNP55196 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
AFDNP55196 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
AFDNP55196 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
AFDNP55196 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
AFDNP55196 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
AFDNP55196 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
AFDNP55196 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
AFDNP55196 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
AFDNP55196 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
AFDNP55196 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
AFDNP55196 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
AFDNP55196 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
AFDNP55196 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
AFDNP55196 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
AFDNP55196 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
AFDNP55196 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
AFDNP55196 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
AFDNP55196 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
AFDNP55196 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
AFDNP55196 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
AFDNP55196 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
AFDNP55196 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
AFDNP55196 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 796.6 ms