Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4P55056 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4P55056 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4P55056 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4P55056 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4P55056 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4P55056 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4P55056 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4P55056 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4P55056 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4P55056 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4P55056 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4P55056 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4P55056 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4P55056 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4P55056 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4P55056 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4P55056 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4P55056 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4P55056 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4P55056 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4P55056 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4P55056 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4P55056 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4P55056 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4P55056 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4P55056 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4P55056 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4P55056 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4P55056 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4P55056 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4P55056 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4P55056 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4P55056 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4P55056 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4P55056 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4P55056 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4P55056 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4P55056 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4P55056 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4P55056 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4P55056 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4P55056 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4P55056 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4P55056 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4P55056 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4P55056 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4P55056 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4P55056 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4P55056 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4P55056 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4P55056 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4P55056 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4P55056 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4P55056 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4P55056 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4P55056 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4P55056 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4P55056 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOC4P55056 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4P55056 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4P55056 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4P55056 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4P55056 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4P55056 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4P55056 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4P55056 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4P55056 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC4P55056 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC4P55056 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC4P55056 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4P55056 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4P55056 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4P55056 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4P55056 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4P55056 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4P55056 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4P55056 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4P55056 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4P55056 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4P55056 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4P55056 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4P55056 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4P55056 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4P55056 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4P55056 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4P55056 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4P55056 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOC4P55056 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4P55056 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4P55056 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4P55056 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4P55056 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4P55056 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4P55056 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4P55056 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4P55056 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4P55056 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4P55056 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4P55056 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms