Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GYS2P54840 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GYS2P54840 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GYS2P54840 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GYS2P54840 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GYS2P54840 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GYS2P54840 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GYS2P54840 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GYS2P54840 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GYS2P54840 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GYS2P54840 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYS2P54840 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYS2P54840 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYS2P54840 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYS2P54840 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYS2P54840 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYS2P54840 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYS2P54840 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GYS2P54840 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GYS2P54840 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GYS2P54840 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GYS2P54840 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GYS2P54840 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GYS2P54840 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GYS2P54840 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GYS2P54840 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GYS2P54840 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GYS2P54840 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GYS2P54840 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GYS2P54840 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GYS2P54840 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GYS2P54840 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GYS2P54840 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GYS2P54840 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GYS2P54840 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GYS2P54840 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GYS2P54840 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GYS2P54840 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GYS2P54840 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GYS2P54840 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GYS2P54840 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GYS2P54840 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GYS2P54840 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GYS2P54840 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GYS2P54840 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GYS2P54840 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GYS2P54840 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS2P54840 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS2P54840 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GYS2P54840 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GYS2P54840 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GYS2P54840 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GYS2P54840 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GYS2P54840 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS2P54840 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS2P54840 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS2P54840 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS2P54840 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS2P54840 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS2P54840 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS2P54840 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS2P54840 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS2P54840 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS2P54840 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS2P54840 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GYS2P54840 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GYS2P54840 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GYS2P54840 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GYS2P54840 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GYS2P54840 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GYS2P54840 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GYS2P54840 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GYS2P54840 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GYS2P54840 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GYS2P54840 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GYS2P54840 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GYS2P54840 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GYS2P54840 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GYS2P54840 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GYS2P54840 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GYS2P54840 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GYS2P54840 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GYS2P54840 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GYS2P54840 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GYS2P54840 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GYS2P54840 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GYS2P54840 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GYS2P54840 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GYS2P54840 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GYS2P54840 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GYS2P54840 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GYS2P54840 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GYS2P54840 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GYS2P54840 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GYS2P54840 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GYS2P54840 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GYS2P54840 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GYS2P54840 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GYS2P54840 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GYS2P54840 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms