Protein–RNA interactions for Protein: P54803

GALC, Galactocerebrosidase, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALCP54803 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GALCP54803 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GALCP54803 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GALCP54803 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GALCP54803 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GALCP54803 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GALCP54803 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GALCP54803 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GALCP54803 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GALCP54803 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GALCP54803 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GALCP54803 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GALCP54803 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GALCP54803 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GALCP54803 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GALCP54803 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GALCP54803 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GALCP54803 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GALCP54803 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GALCP54803 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GALCP54803 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GALCP54803 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GALCP54803 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GALCP54803 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GALCP54803 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GALCP54803 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GALCP54803 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GALCP54803 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GALCP54803 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GALCP54803 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GALCP54803 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GALCP54803 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GALCP54803 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GALCP54803 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GALCP54803 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GALCP54803 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GALCP54803 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GALCP54803 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GALCP54803 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GALCP54803 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GALCP54803 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GALCP54803 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GALCP54803 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GALCP54803 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GALCP54803 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GALCP54803 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GALCP54803 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GALCP54803 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GALCP54803 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GALCP54803 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GALCP54803 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GALCP54803 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GALCP54803 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GALCP54803 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GALCP54803 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GALCP54803 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GALCP54803 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GALCP54803 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GALCP54803 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GALCP54803 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GALCP54803 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GALCP54803 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GALCP54803 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GALCP54803 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GALCP54803 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GALCP54803 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GALCP54803 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GALCP54803 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GALCP54803 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GALCP54803 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GALCP54803 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GALCP54803 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GALCP54803 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GALCP54803 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GALCP54803 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GALCP54803 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GALCP54803 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GALCP54803 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GALCP54803 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GALCP54803 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GALCP54803 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GALCP54803 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GALCP54803 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GALCP54803 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GALCP54803 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GALCP54803 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GALCP54803 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GALCP54803 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GALCP54803 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GALCP54803 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GALCP54803 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GALCP54803 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GALCP54803 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GALCP54803 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GALCP54803 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GALCP54803 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GALCP54803 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GALCP54803 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GALCP54803 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GALCP54803 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms