Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LHX1P48742 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LHX1P48742 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LHX1P48742 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LHX1P48742 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LHX1P48742 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LHX1P48742 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LHX1P48742 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LHX1P48742 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LHX1P48742 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LHX1P48742 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LHX1P48742 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LHX1P48742 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LHX1P48742 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LHX1P48742 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LHX1P48742 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LHX1P48742 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LHX1P48742 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LHX1P48742 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LHX1P48742 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LHX1P48742 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LHX1P48742 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LHX1P48742 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LHX1P48742 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LHX1P48742 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LHX1P48742 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LHX1P48742 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LHX1P48742 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LHX1P48742 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LHX1P48742 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LHX1P48742 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LHX1P48742 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LHX1P48742 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LHX1P48742 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LHX1P48742 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LHX1P48742 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LHX1P48742 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LHX1P48742 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LHX1P48742 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LHX1P48742 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LHX1P48742 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LHX1P48742 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LHX1P48742 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LHX1P48742 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LHX1P48742 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LHX1P48742 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LHX1P48742 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LHX1P48742 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LHX1P48742 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LHX1P48742 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LHX1P48742 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LHX1P48742 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LHX1P48742 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LHX1P48742 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LHX1P48742 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LHX1P48742 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LHX1P48742 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LHX1P48742 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LHX1P48742 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LHX1P48742 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LHX1P48742 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LHX1P48742 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LHX1P48742 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LHX1P48742 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LHX1P48742 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LHX1P48742 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LHX1P48742 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LHX1P48742 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LHX1P48742 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LHX1P48742 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LHX1P48742 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LHX1P48742 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LHX1P48742 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LHX1P48742 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LHX1P48742 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LHX1P48742 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LHX1P48742 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LHX1P48742 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LHX1P48742 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LHX1P48742 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LHX1P48742 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LHX1P48742 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LHX1P48742 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LHX1P48742 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LHX1P48742 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LHX1P48742 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LHX1P48742 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LHX1P48742 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LHX1P48742 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LHX1P48742 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LHX1P48742 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LHX1P48742 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX1P48742 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX1P48742 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX1P48742 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LHX1P48742 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LHX1P48742 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LHX1P48742 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LHX1P48742 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LHX1P48742 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms