Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
KDM5CP41229 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.09■■■■■ 4.49
KDM5CP41229 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
KDM5CP41229 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
KDM5CP41229 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
KDM5CP41229 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
KDM5CP41229 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
KDM5CP41229 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
KDM5CP41229 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
KDM5CP41229 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
KDM5CP41229 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
KDM5CP41229 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
KDM5CP41229 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
KDM5CP41229 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
KDM5CP41229 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
KDM5CP41229 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM5CP41229 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM5CP41229 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM5CP41229 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM5CP41229 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM5CP41229 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
KDM5CP41229 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
KDM5CP41229 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
KDM5CP41229 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
KDM5CP41229 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
KDM5CP41229 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
KDM5CP41229 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
KDM5CP41229 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
KDM5CP41229 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
KDM5CP41229 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
KDM5CP41229 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
KDM5CP41229 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
KDM5CP41229 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
KDM5CP41229 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
KDM5CP41229 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
KDM5CP41229 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
KDM5CP41229 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
KDM5CP41229 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
KDM5CP41229 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
KDM5CP41229 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
KDM5CP41229 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
KDM5CP41229 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
KDM5CP41229 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
KDM5CP41229 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KDM5CP41229 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KDM5CP41229 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
KDM5CP41229 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.39
KDM5CP41229 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
KDM5CP41229 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
KDM5CP41229 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
KDM5CP41229 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
KDM5CP41229 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
KDM5CP41229 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
KDM5CP41229 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
KDM5CP41229 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
KDM5CP41229 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
KDM5CP41229 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM5CP41229 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM5CP41229 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
KDM5CP41229 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
KDM5CP41229 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM5CP41229 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5CP41229 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
KDM5CP41229 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
KDM5CP41229 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM5CP41229 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM5CP41229 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
KDM5CP41229 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM5CP41229 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM5CP41229 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
KDM5CP41229 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
KDM5CP41229 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
KDM5CP41229 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM5CP41229 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
KDM5CP41229 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM5CP41229 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM5CP41229 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM5CP41229 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM5CP41229 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms