Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP8P40818 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP8P40818 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP8P40818 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP8P40818 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP8P40818 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP8P40818 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP8P40818 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP8P40818 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP8P40818 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP8P40818 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP8P40818 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
USP8P40818 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP8P40818 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP8P40818 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP8P40818 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP8P40818 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP8P40818 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP8P40818 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP8P40818 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP8P40818 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP8P40818 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP8P40818 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP8P40818 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP8P40818 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP8P40818 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP8P40818 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP8P40818 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP8P40818 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP8P40818 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP8P40818 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP8P40818 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP8P40818 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP8P40818 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP8P40818 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP8P40818 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP8P40818 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP8P40818 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP8P40818 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP8P40818 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP8P40818 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP8P40818 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP8P40818 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP8P40818 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP8P40818 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP8P40818 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP8P40818 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP8P40818 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP8P40818 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP8P40818 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP8P40818 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP8P40818 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP8P40818 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP8P40818 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP8P40818 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP8P40818 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP8P40818 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP8P40818 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP8P40818 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP8P40818 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP8P40818 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP8P40818 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP8P40818 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP8P40818 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP8P40818 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP8P40818 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP8P40818 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP8P40818 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP8P40818 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP8P40818 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP8P40818 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP8P40818 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP8P40818 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP8P40818 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP8P40818 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP8P40818 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP8P40818 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP8P40818 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP8P40818 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP8P40818 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP8P40818 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP8P40818 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP8P40818 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP8P40818 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP8P40818 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP8P40818 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP8P40818 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP8P40818 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP8P40818 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP8P40818 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP8P40818 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP8P40818 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP8P40818 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP8P40818 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP8P40818 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP8P40818 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP8P40818 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP8P40818 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP8P40818 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP8P40818 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms