Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
COL4A5P29400 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
COL4A5P29400 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
COL4A5P29400 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
COL4A5P29400 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
COL4A5P29400 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL4A5P29400 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL4A5P29400 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL4A5P29400 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
COL4A5P29400 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL4A5P29400 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL4A5P29400 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL4A5P29400 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL4A5P29400 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL4A5P29400 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COL4A5P29400 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL4A5P29400 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
COL4A5P29400 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COL4A5P29400 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL4A5P29400 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
COL4A5P29400 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL4A5P29400 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL4A5P29400 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
COL4A5P29400 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL4A5P29400 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL4A5P29400 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL4A5P29400 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL4A5P29400 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL4A5P29400 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL4A5P29400 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL4A5P29400 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL4A5P29400 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL4A5P29400 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
COL4A5P29400 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
COL4A5P29400 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
COL4A5P29400 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
COL4A5P29400 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL4A5P29400 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
COL4A5P29400 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL4A5P29400 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL4A5P29400 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL4A5P29400 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL4A5P29400 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL4A5P29400 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
COL4A5P29400 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL4A5P29400 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL4A5P29400 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
COL4A5P29400 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL4A5P29400 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL4A5P29400 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL4A5P29400 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL4A5P29400 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL4A5P29400 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL4A5P29400 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL4A5P29400 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
COL4A5P29400 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL4A5P29400 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
COL4A5P29400 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.79■■■■□ 3
COL4A5P29400 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL4A5P29400 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
COL4A5P29400 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms