Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
DNMT1P26358 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
DNMT1P26358 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
DNMT1P26358 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
DNMT1P26358 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
DNMT1P26358 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
DNMT1P26358 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DNMT1P26358 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
DNMT1P26358 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
DNMT1P26358 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
DNMT1P26358 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
DNMT1P26358 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
DNMT1P26358 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
DNMT1P26358 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
DNMT1P26358 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
DNMT1P26358 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
DNMT1P26358 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
DNMT1P26358 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
DNMT1P26358 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
DNMT1P26358 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
DNMT1P26358 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
DNMT1P26358 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
DNMT1P26358 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
DNMT1P26358 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
DNMT1P26358 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
DNMT1P26358 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
DNMT1P26358 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
DNMT1P26358 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
DNMT1P26358 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
DNMT1P26358 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.35
DNMT1P26358 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
DNMT1P26358 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
DNMT1P26358 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DNMT1P26358 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
DNMT1P26358 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
DNMT1P26358 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
DNMT1P26358 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
DNMT1P26358 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
DNMT1P26358 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
DNMT1P26358 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
DNMT1P26358 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
DNMT1P26358 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
DNMT1P26358 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
DNMT1P26358 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
DNMT1P26358 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
DNMT1P26358 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
DNMT1P26358 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
DNMT1P26358 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
DNMT1P26358 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
DNMT1P26358 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
DNMT1P26358 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
DNMT1P26358 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
DNMT1P26358 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
DNMT1P26358 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DNMT1P26358 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DNMT1P26358 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
DNMT1P26358 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
DNMT1P26358 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
DNMT1P26358 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.77■■■■■ 4.28
DNMT1P26358 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
DNMT1P26358 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
DNMT1P26358 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
DNMT1P26358 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
DNMT1P26358 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
DNMT1P26358 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
DNMT1P26358 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
DNMT1P26358 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
DNMT1P26358 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
DNMT1P26358 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
DNMT1P26358 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
DNMT1P26358 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
DNMT1P26358 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
DNMT1P26358 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
DNMT1P26358 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
DNMT1P26358 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
DNMT1P26358 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
DNMT1P26358 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
DNMT1P26358 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
DNMT1P26358 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DNMT1P26358 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DNMT1P26358 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.51■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms