Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGA6P23229 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGA6P23229 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGA6P23229 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ITGA6P23229 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ITGA6P23229 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGA6P23229 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGA6P23229 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGA6P23229 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGA6P23229 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGA6P23229 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGA6P23229 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGA6P23229 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGA6P23229 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ITGA6P23229 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITGA6P23229 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITGA6P23229 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGA6P23229 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ITGA6P23229 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITGA6P23229 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGA6P23229 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ITGA6P23229 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITGA6P23229 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITGA6P23229 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGA6P23229 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGA6P23229 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGA6P23229 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGA6P23229 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGA6P23229 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGA6P23229 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ITGA6P23229 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGA6P23229 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGA6P23229 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGA6P23229 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGA6P23229 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGA6P23229 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGA6P23229 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGA6P23229 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGA6P23229 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGA6P23229 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGA6P23229 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGA6P23229 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGA6P23229 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGA6P23229 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGA6P23229 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGA6P23229 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms