Protein–RNA interactions for Protein: P22303

ACHE, Acetylcholinesterase, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHEP22303 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACHEP22303 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACHEP22303 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACHEP22303 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACHEP22303 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACHEP22303 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACHEP22303 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACHEP22303 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACHEP22303 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACHEP22303 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACHEP22303 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACHEP22303 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACHEP22303 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACHEP22303 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACHEP22303 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACHEP22303 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACHEP22303 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACHEP22303 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACHEP22303 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACHEP22303 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACHEP22303 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACHEP22303 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACHEP22303 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACHEP22303 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACHEP22303 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACHEP22303 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACHEP22303 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACHEP22303 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACHEP22303 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACHEP22303 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACHEP22303 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACHEP22303 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACHEP22303 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACHEP22303 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACHEP22303 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACHEP22303 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACHEP22303 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACHEP22303 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACHEP22303 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACHEP22303 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACHEP22303 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACHEP22303 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACHEP22303 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACHEP22303 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACHEP22303 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACHEP22303 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACHEP22303 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACHEP22303 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACHEP22303 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACHEP22303 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACHEP22303 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACHEP22303 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACHEP22303 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACHEP22303 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACHEP22303 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACHEP22303 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACHEP22303 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACHEP22303 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACHEP22303 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACHEP22303 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACHEP22303 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACHEP22303 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACHEP22303 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACHEP22303 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACHEP22303 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACHEP22303 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACHEP22303 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACHEP22303 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACHEP22303 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACHEP22303 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACHEP22303 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACHEP22303 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACHEP22303 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACHEP22303 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACHEP22303 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACHEP22303 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACHEP22303 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACHEP22303 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACHEP22303 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACHEP22303 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACHEP22303 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACHEP22303 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACHEP22303 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACHEP22303 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACHEP22303 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACHEP22303 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACHEP22303 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACHEP22303 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACHEP22303 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACHEP22303 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACHEP22303 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACHEP22303 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACHEP22303 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACHEP22303 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACHEP22303 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACHEP22303 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACHEP22303 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACHEP22303 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACHEP22303 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACHEP22303 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms