Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB4AP20338 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB4AP20338 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB4AP20338 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB4AP20338 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB4AP20338 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB4AP20338 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAB4AP20338 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB4AP20338 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB4AP20338 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB4AP20338 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
RAB4AP20338 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms