Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD33P20138 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD33P20138 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD33P20138 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD33P20138 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD33P20138 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD33P20138 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD33P20138 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD33P20138 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD33P20138 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD33P20138 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD33P20138 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD33P20138 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD33P20138 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD33P20138 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD33P20138 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD33P20138 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD33P20138 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD33P20138 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD33P20138 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD33P20138 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD33P20138 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD33P20138 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD33P20138 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD33P20138 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD33P20138 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD33P20138 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD33P20138 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD33P20138 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD33P20138 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD33P20138 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD33P20138 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD33P20138 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD33P20138 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD33P20138 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD33P20138 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD33P20138 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD33P20138 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD33P20138 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD33P20138 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD33P20138 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD33P20138 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD33P20138 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD33P20138 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD33P20138 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD33P20138 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD33P20138 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD33P20138 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD33P20138 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CD33P20138 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD33P20138 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD33P20138 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD33P20138 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD33P20138 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD33P20138 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD33P20138 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD33P20138 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD33P20138 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD33P20138 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD33P20138 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD33P20138 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD33P20138 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD33P20138 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD33P20138 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD33P20138 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD33P20138 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD33P20138 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD33P20138 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD33P20138 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD33P20138 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD33P20138 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD33P20138 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD33P20138 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD33P20138 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD33P20138 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD33P20138 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD33P20138 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD33P20138 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD33P20138 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD33P20138 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD33P20138 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD33P20138 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD33P20138 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD33P20138 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD33P20138 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD33P20138 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD33P20138 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD33P20138 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD33P20138 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD33P20138 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD33P20138 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD33P20138 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD33P20138 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD33P20138 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD33P20138 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD33P20138 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD33P20138 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD33P20138 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD33P20138 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD33P20138 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms