Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DESP17661 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DESP17661 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DESP17661 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DESP17661 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DESP17661 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DESP17661 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DESP17661 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DESP17661 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DESP17661 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DESP17661 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DESP17661 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DESP17661 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DESP17661 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DESP17661 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DESP17661 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DESP17661 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DESP17661 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DESP17661 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DESP17661 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DESP17661 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DESP17661 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DESP17661 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DESP17661 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DESP17661 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DESP17661 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DESP17661 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DESP17661 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DESP17661 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DESP17661 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DESP17661 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DESP17661 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DESP17661 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DESP17661 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DESP17661 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DESP17661 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DESP17661 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DESP17661 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DESP17661 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DESP17661 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DESP17661 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DESP17661 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DESP17661 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DESP17661 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DESP17661 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DESP17661 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DESP17661 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DESP17661 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DESP17661 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DESP17661 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DESP17661 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DESP17661 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DESP17661 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DESP17661 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DESP17661 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DESP17661 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DESP17661 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DESP17661 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DESP17661 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DESP17661 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DESP17661 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DESP17661 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DESP17661 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DESP17661 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DESP17661 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DESP17661 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DESP17661 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DESP17661 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DESP17661 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DESP17661 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DESP17661 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DESP17661 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DESP17661 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DESP17661 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DESP17661 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DESP17661 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DESP17661 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DESP17661 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DESP17661 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DESP17661 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
DESP17661 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DESP17661 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DESP17661 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DESP17661 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DESP17661 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DESP17661 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DESP17661 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DESP17661 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DESP17661 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DESP17661 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DESP17661 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DESP17661 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DESP17661 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DESP17661 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DESP17661 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DESP17661 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DESP17661 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DESP17661 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DESP17661 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DESP17661 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms