Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYL4P12829 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYL4P12829 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYL4P12829 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYL4P12829 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYL4P12829 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYL4P12829 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYL4P12829 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYL4P12829 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYL4P12829 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYL4P12829 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYL4P12829 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYL4P12829 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MYL4P12829 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYL4P12829 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYL4P12829 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MYL4P12829 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL4P12829 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL4P12829 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL4P12829 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL4P12829 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL4P12829 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYL4P12829 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYL4P12829 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MYL4P12829 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYL4P12829 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYL4P12829 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MYL4P12829 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYL4P12829 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYL4P12829 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYL4P12829 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYL4P12829 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYL4P12829 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYL4P12829 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYL4P12829 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYL4P12829 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYL4P12829 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYL4P12829 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYL4P12829 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYL4P12829 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYL4P12829 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYL4P12829 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYL4P12829 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYL4P12829 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MYL4P12829 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYL4P12829 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYL4P12829 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYL4P12829 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYL4P12829 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MYL4P12829 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYL4P12829 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYL4P12829 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYL4P12829 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYL4P12829 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
MYL4P12829 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYL4P12829 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYL4P12829 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYL4P12829 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYL4P12829 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYL4P12829 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYL4P12829 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL4P12829 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL4P12829 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL4P12829 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYL4P12829 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYL4P12829 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYL4P12829 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYL4P12829 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYL4P12829 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYL4P12829 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYL4P12829 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYL4P12829 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYL4P12829 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MYL4P12829 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYL4P12829 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYL4P12829 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYL4P12829 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYL4P12829 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYL4P12829 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYL4P12829 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYL4P12829 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYL4P12829 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MYL4P12829 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYL4P12829 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYL4P12829 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYL4P12829 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYL4P12829 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYL4P12829 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MYL4P12829 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYL4P12829 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYL4P12829 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYL4P12829 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYL4P12829 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYL4P12829 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYL4P12829 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYL4P12829 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MYL4P12829 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MYL4P12829 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYL4P12829 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYL4P12829 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms