Protein–RNA interactions for Protein: P10643

C7, Complement component C7, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7P10643 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C7P10643 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C7P10643 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C7P10643 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C7P10643 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C7P10643 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C7P10643 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C7P10643 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C7P10643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
C7P10643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C7P10643 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C7P10643 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C7P10643 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C7P10643 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C7P10643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C7P10643 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C7P10643 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C7P10643 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C7P10643 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C7P10643 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C7P10643 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C7P10643 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C7P10643 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
C7P10643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C7P10643 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C7P10643 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C7P10643 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C7P10643 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C7P10643 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C7P10643 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C7P10643 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C7P10643 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C7P10643 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C7P10643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C7P10643 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C7P10643 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C7P10643 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C7P10643 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C7P10643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
C7P10643 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C7P10643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C7P10643 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C7P10643 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C7P10643 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C7P10643 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C7P10643 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7P10643 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7P10643 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7P10643 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7P10643 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7P10643 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7P10643 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C7P10643 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C7P10643 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C7P10643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7P10643 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7P10643 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C7P10643 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7P10643 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C7P10643 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C7P10643 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C7P10643 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7P10643 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7P10643 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7P10643 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7P10643 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7P10643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7P10643 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7P10643 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7P10643 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7P10643 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7P10643 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7P10643 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7P10643 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7P10643 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7P10643 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C7P10643 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C7P10643 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
C7P10643 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7P10643 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C7P10643 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7P10643 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C7P10643 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7P10643 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C7P10643 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C7P10643 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C7P10643 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C7P10643 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C7P10643 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C7P10643 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7P10643 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7P10643 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C7P10643 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C7P10643 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C7P10643 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C7P10643 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C7P10643 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C7P10643 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
C7P10643 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7P10643 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms