Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
C4BP0C0L5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
C4BP0C0L5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
C4BP0C0L5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
C4BP0C0L5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
C4BP0C0L5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C4BP0C0L5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
C4BP0C0L5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C4BP0C0L5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
C4BP0C0L5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
C4BP0C0L5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C4BP0C0L5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
C4BP0C0L5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
C4BP0C0L5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C4BP0C0L5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C4BP0C0L5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C4BP0C0L5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
C4BP0C0L5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
C4BP0C0L5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
C4BP0C0L5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
C4BP0C0L5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
C4BP0C0L5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
C4BP0C0L5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
C4BP0C0L5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C4BP0C0L5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
C4BP0C0L5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
C4BP0C0L5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
C4BP0C0L5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
C4BP0C0L5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
C4BP0C0L5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
C4BP0C0L5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
C4BP0C0L5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
C4BP0C0L5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
C4BP0C0L5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
C4BP0C0L5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
C4BP0C0L5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
C4BP0C0L5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
C4BP0C0L5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
C4BP0C0L5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
C4BP0C0L5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
C4BP0C0L5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
C4BP0C0L5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
C4BP0C0L5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
C4BP0C0L5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
C4BP0C0L5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
C4BP0C0L5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
C4BP0C0L5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
C4BP0C0L5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
C4BP0C0L5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
C4BP0C0L5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
C4BP0C0L5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
C4BP0C0L5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
C4BP0C0L5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
C4BP0C0L5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
C4BP0C0L5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
C4BP0C0L5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
C4BP0C0L5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
C4BP0C0L5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
C4BP0C0L5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
C4BP0C0L5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
C4BP0C0L5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
C4BP0C0L5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
C4BP0C0L5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
C4BP0C0L5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
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