Protein–RNA interactions for Protein: P08514

ITGA2B, Integrin alpha-IIb, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2BP08514 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA2BP08514 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA2BP08514 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA2BP08514 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA2BP08514 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA2BP08514 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA2BP08514 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA2BP08514 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGA2BP08514 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA2BP08514 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA2BP08514 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA2BP08514 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA2BP08514 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA2BP08514 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA2BP08514 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA2BP08514 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA2BP08514 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA2BP08514 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA2BP08514 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA2BP08514 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA2BP08514 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms