Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPBP07988 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPBP07988 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPBP07988 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPBP07988 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPBP07988 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPBP07988 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFTPBP07988 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPBP07988 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPBP07988 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFTPBP07988 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPBP07988 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPBP07988 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPBP07988 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPBP07988 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPBP07988 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPBP07988 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms