Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA17P01571 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA17P01571 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNA17P01571 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA17P01571 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA17P01571 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFNA17P01571 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA17P01571 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA17P01571 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA17P01571 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA17P01571 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA17P01571 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA17P01571 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA17P01571 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA17P01571 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA17P01571 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA17P01571 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA17P01571 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA17P01571 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA17P01571 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA17P01571 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA17P01571 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA17P01571 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA17P01571 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms