Protein–RNA interactions for Protein: P00995

SPINK1, Serine protease inhibitor Kazal-type 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK1P00995 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPINK1P00995 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINK1P00995 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPINK1P00995 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK1P00995 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK1P00995 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPINK1P00995 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPINK1P00995 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms