Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTL6AO96019 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms