Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRUB2O95900 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRUB2O95900 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRUB2O95900 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRUB2O95900 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRUB2O95900 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRUB2O95900 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRUB2O95900 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRUB2O95900 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRUB2O95900 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRUB2O95900 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRUB2O95900 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRUB2O95900 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRUB2O95900 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRUB2O95900 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRUB2O95900 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRUB2O95900 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRUB2O95900 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRUB2O95900 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRUB2O95900 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRUB2O95900 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRUB2O95900 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRUB2O95900 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRUB2O95900 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRUB2O95900 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRUB2O95900 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRUB2O95900 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRUB2O95900 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRUB2O95900 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms