Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIOO75962 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIOO75962 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIOO75962 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIOO75962 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIOO75962 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIOO75962 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIOO75962 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIOO75962 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIOO75962 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIOO75962 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIOO75962 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIOO75962 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIOO75962 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIOO75962 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIOO75962 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIOO75962 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIOO75962 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIOO75962 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIOO75962 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIOO75962 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIOO75962 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIOO75962 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIOO75962 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIOO75962 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIOO75962 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIOO75962 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRIOO75962 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIOO75962 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIOO75962 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIOO75962 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIOO75962 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIOO75962 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIOO75962 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIOO75962 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIOO75962 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIOO75962 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIOO75962 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIOO75962 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIOO75962 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOO75962 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOO75962 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOO75962 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOO75962 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIOO75962 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIOO75962 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIOO75962 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIOO75962 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIOO75962 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIOO75962 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIOO75962 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIOO75962 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIOO75962 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIOO75962 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIOO75962 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIOO75962 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIOO75962 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIOO75962 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIOO75962 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIOO75962 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIOO75962 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIOO75962 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIOO75962 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIOO75962 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIOO75962 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIOO75962 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIOO75962 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIOO75962 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIOO75962 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIOO75962 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIOO75962 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIOO75962 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIOO75962 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIOO75962 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIOO75962 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIOO75962 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIOO75962 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIOO75962 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIOO75962 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIOO75962 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIOO75962 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIOO75962 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIOO75962 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIOO75962 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIOO75962 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIOO75962 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIOO75962 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIOO75962 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIOO75962 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIOO75962 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIOO75962 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIOO75962 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIOO75962 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIOO75962 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIOO75962 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIOO75962 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIOO75962 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIOO75962 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIOO75962 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIOO75962 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms