Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KATNA1O75449 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KATNA1O75449 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KATNA1O75449 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KATNA1O75449 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KATNA1O75449 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KATNA1O75449 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KATNA1O75449 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KATNA1O75449 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KATNA1O75449 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KATNA1O75449 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KATNA1O75449 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KATNA1O75449 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KATNA1O75449 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KATNA1O75449 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KATNA1O75449 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KATNA1O75449 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KATNA1O75449 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KATNA1O75449 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KATNA1O75449 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KATNA1O75449 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KATNA1O75449 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KATNA1O75449 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KATNA1O75449 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms