Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H2AFYO75367 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
H2AFYO75367 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
H2AFYO75367 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H2AFYO75367 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
H2AFYO75367 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2AFYO75367 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2AFYO75367 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2AFYO75367 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2AFYO75367 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2AFYO75367 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H2AFYO75367 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H2AFYO75367 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
H2AFYO75367 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H2AFYO75367 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H2AFYO75367 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2AFYO75367 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
H2AFYO75367 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2AFYO75367 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2AFYO75367 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
H2AFYO75367 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2AFYO75367 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2AFYO75367 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2AFYO75367 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms