Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PLXNC1O60486 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PLXNC1O60486 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
PLXNC1O60486 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
PLXNC1O60486 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PLXNC1O60486 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PLXNC1O60486 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PLXNC1O60486 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.53■■■■■ 4.4
PLXNC1O60486 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PLXNC1O60486 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PLXNC1O60486 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PLXNC1O60486 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PLXNC1O60486 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PLXNC1O60486 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PLXNC1O60486 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PLXNC1O60486 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PLXNC1O60486 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PLXNC1O60486 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PLXNC1O60486 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
PLXNC1O60486 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PLXNC1O60486 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PLXNC1O60486 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
PLXNC1O60486 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PLXNC1O60486 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PLXNC1O60486 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PLXNC1O60486 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.35
PLXNC1O60486 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PLXNC1O60486 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PLXNC1O60486 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PLXNC1O60486 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
PLXNC1O60486 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PLXNC1O60486 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PLXNC1O60486 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PLXNC1O60486 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PLXNC1O60486 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PLXNC1O60486 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PLXNC1O60486 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PLXNC1O60486 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PLXNC1O60486 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
PLXNC1O60486 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PLXNC1O60486 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PLXNC1O60486 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PLXNC1O60486 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PLXNC1O60486 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
PLXNC1O60486 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
PLXNC1O60486 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
PLXNC1O60486 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PLXNC1O60486 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PLXNC1O60486 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PLXNC1O60486 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PLXNC1O60486 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
PLXNC1O60486 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PLXNC1O60486 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PLXNC1O60486 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PLXNC1O60486 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PLXNC1O60486 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PLXNC1O60486 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
PLXNC1O60486 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PLXNC1O60486 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PLXNC1O60486 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PLXNC1O60486 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PLXNC1O60486 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PLXNC1O60486 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PLXNC1O60486 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PLXNC1O60486 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PLXNC1O60486 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PLXNC1O60486 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PLXNC1O60486 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PLXNC1O60486 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms