Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DENRO43583 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DENRO43583 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DENRO43583 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DENRO43583 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DENRO43583 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DENRO43583 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENRO43583 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENRO43583 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENRO43583 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENRO43583 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENRO43583 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENRO43583 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DENRO43583 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENRO43583 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENRO43583 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DENRO43583 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENRO43583 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DENRO43583 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DENRO43583 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENRO43583 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENRO43583 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENRO43583 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENRO43583 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENRO43583 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENRO43583 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENRO43583 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENRO43583 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENRO43583 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENRO43583 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENRO43583 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENRO43583 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENRO43583 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENRO43583 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENRO43583 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENRO43583 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENRO43583 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENRO43583 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENRO43583 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENRO43583 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENRO43583 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENRO43583 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENRO43583 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENRO43583 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENRO43583 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENRO43583 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENRO43583 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENRO43583 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENRO43583 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENRO43583 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENRO43583 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENRO43583 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENRO43583 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENRO43583 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENRO43583 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENRO43583 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENRO43583 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENRO43583 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENRO43583 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENRO43583 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENRO43583 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENRO43583 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENRO43583 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENRO43583 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENRO43583 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENRO43583 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENRO43583 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENRO43583 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENRO43583 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENRO43583 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENRO43583 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENRO43583 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENRO43583 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENRO43583 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENRO43583 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENRO43583 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DENRO43583 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DENRO43583 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DENRO43583 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DENRO43583 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENRO43583 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENRO43583 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENRO43583 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DENRO43583 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENRO43583 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENRO43583 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENRO43583 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENRO43583 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENRO43583 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENRO43583 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENRO43583 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENRO43583 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENRO43583 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENRO43583 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENRO43583 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENRO43583 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENRO43583 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENRO43583 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENRO43583 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENRO43583 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms