Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTIFO43310 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTIFO43310 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTIFO43310 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTIFO43310 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTIFO43310 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTIFO43310 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTIFO43310 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTIFO43310 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTIFO43310 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTIFO43310 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CTIFO43310 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTIFO43310 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTIFO43310 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTIFO43310 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTIFO43310 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTIFO43310 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTIFO43310 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTIFO43310 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTIFO43310 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTIFO43310 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTIFO43310 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTIFO43310 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTIFO43310 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTIFO43310 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTIFO43310 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTIFO43310 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTIFO43310 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTIFO43310 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTIFO43310 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTIFO43310 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTIFO43310 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTIFO43310 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTIFO43310 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTIFO43310 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTIFO43310 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTIFO43310 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTIFO43310 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTIFO43310 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTIFO43310 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTIFO43310 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTIFO43310 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTIFO43310 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTIFO43310 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTIFO43310 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTIFO43310 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTIFO43310 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTIFO43310 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTIFO43310 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTIFO43310 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTIFO43310 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTIFO43310 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTIFO43310 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTIFO43310 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTIFO43310 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTIFO43310 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTIFO43310 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTIFO43310 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTIFO43310 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTIFO43310 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTIFO43310 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTIFO43310 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTIFO43310 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTIFO43310 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTIFO43310 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTIFO43310 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTIFO43310 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTIFO43310 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTIFO43310 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTIFO43310 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTIFO43310 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTIFO43310 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTIFO43310 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTIFO43310 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTIFO43310 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTIFO43310 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTIFO43310 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTIFO43310 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTIFO43310 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTIFO43310 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTIFO43310 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTIFO43310 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTIFO43310 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTIFO43310 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTIFO43310 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTIFO43310 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTIFO43310 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTIFO43310 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTIFO43310 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTIFO43310 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTIFO43310 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTIFO43310 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTIFO43310 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTIFO43310 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTIFO43310 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTIFO43310 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTIFO43310 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTIFO43310 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTIFO43310 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTIFO43310 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
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