Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCP110O43303 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCP110O43303 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCP110O43303 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCP110O43303 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCP110O43303 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCP110O43303 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCP110O43303 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCP110O43303 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCP110O43303 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCP110O43303 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCP110O43303 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCP110O43303 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCP110O43303 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCP110O43303 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCP110O43303 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCP110O43303 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCP110O43303 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCP110O43303 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCP110O43303 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCP110O43303 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCP110O43303 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCP110O43303 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCP110O43303 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCP110O43303 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCP110O43303 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCP110O43303 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCP110O43303 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCP110O43303 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCP110O43303 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCP110O43303 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCP110O43303 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCP110O43303 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCP110O43303 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCP110O43303 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCP110O43303 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCP110O43303 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CCP110O43303 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCP110O43303 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCP110O43303 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCP110O43303 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCP110O43303 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCP110O43303 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCP110O43303 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCP110O43303 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCP110O43303 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCP110O43303 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCP110O43303 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CCP110O43303 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCP110O43303 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCP110O43303 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCP110O43303 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCP110O43303 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCP110O43303 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCP110O43303 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCP110O43303 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCP110O43303 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCP110O43303 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCP110O43303 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCP110O43303 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCP110O43303 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCP110O43303 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCP110O43303 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCP110O43303 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCP110O43303 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCP110O43303 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCP110O43303 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCP110O43303 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCP110O43303 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCP110O43303 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCP110O43303 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCP110O43303 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCP110O43303 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CCP110O43303 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCP110O43303 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCP110O43303 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCP110O43303 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCP110O43303 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCP110O43303 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCP110O43303 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCP110O43303 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCP110O43303 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCP110O43303 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCP110O43303 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCP110O43303 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCP110O43303 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCP110O43303 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCP110O43303 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCP110O43303 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCP110O43303 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCP110O43303 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCP110O43303 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCP110O43303 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCP110O43303 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCP110O43303 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCP110O43303 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCP110O43303 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCP110O43303 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCP110O43303 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCP110O43303 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms