Protein–RNA interactions for Protein: O43169

CYB5B, Cytochrome b5 type B, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB5BO43169 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYB5BO43169 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYB5BO43169 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYB5BO43169 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYB5BO43169 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYB5BO43169 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYB5BO43169 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYB5BO43169 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYB5BO43169 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYB5BO43169 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYB5BO43169 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYB5BO43169 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYB5BO43169 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYB5BO43169 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB5BO43169 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYB5BO43169 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYB5BO43169 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB5BO43169 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms