Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
KDM6BO15054 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
KDM6BO15054 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
KDM6BO15054 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
KDM6BO15054 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
KDM6BO15054 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.32■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.26■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
KDM6BO15054 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
KDM6BO15054 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
KDM6BO15054 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
KDM6BO15054 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
KDM6BO15054 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
KDM6BO15054 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
KDM6BO15054 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
KDM6BO15054 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
KDM6BO15054 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
KDM6BO15054 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.73■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.35■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
KDM6BO15054 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
KDM6BO15054 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.26■■■■■ 4.52
KDM6BO15054 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
KDM6BO15054 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
KDM6BO15054 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
KDM6BO15054 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms