Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms