Protein–RNA interactions for Protein: B6A8C7

TARM1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARM1B6A8C7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TARM1B6A8C7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TARM1B6A8C7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TARM1B6A8C7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TARM1B6A8C7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TARM1B6A8C7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TARM1B6A8C7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TARM1B6A8C7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TARM1B6A8C7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TARM1B6A8C7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TARM1B6A8C7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TARM1B6A8C7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TARM1B6A8C7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TARM1B6A8C7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TARM1B6A8C7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TARM1B6A8C7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TARM1B6A8C7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TARM1B6A8C7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TARM1B6A8C7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TARM1B6A8C7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TARM1B6A8C7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TARM1B6A8C7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TARM1B6A8C7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TARM1B6A8C7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TARM1B6A8C7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TARM1B6A8C7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TARM1B6A8C7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TARM1B6A8C7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TARM1B6A8C7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TARM1B6A8C7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TARM1B6A8C7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TARM1B6A8C7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TARM1B6A8C7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms