Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4DGG1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4DGG1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4DGG1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4DGG1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4DGG1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
B4DGG1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4DGG1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4DGG1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
B4DGG1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
B4DGG1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
B4DGG1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
B4DGG1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
B4DGG1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4DGG1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4DGG1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4DGG1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
B4DGG1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4DGG1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
B4DGG1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
B4DGG1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
B4DGG1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
B4DGG1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
B4DGG1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4DGG1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4DGG1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4DGG1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4DGG1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
B4DGG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4DGG1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4DGG1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4DGG1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4DGG1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
B4DGG1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
B4DGG1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4DGG1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4DGG1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
B4DGG1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4DGG1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4DGG1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4DGG1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4DGG1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4DGG1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4DGG1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
B4DGG1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
B4DGG1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4DGG1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4DGG1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4DGG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4DGG1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4DGG1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4DGG1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4DGG1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4DGG1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4DGG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4DGG1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
B4DGG1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4DGG1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
B4DGG1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
B4DGG1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4DGG1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4DGG1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4DGG1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
B4DGG1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DGG1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DGG1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DGG1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DGG1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DGG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DGG1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DGG1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DGG1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DGG1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DGG1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DGG1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DGG1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DGG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DGG1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DGG1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DGG1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DGG1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4DGG1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4DGG1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4DGG1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
B4DGG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4DGG1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
B4DGG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DGG1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DGG1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DGG1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DGG1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DGG1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4DGG1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4DGG1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4DGG1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
B4DGG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4DGG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DGG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DGG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DGG1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms