Protein–RNA interactions for Protein: B1AJZ1

C1orf196, Putative uncharacterized protein C1orf196, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf196B1AJZ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf196B1AJZ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf196B1AJZ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf196B1AJZ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf196B1AJZ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf196B1AJZ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf196B1AJZ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf196B1AJZ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf196B1AJZ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf196B1AJZ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf196B1AJZ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf196B1AJZ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf196B1AJZ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf196B1AJZ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf196B1AJZ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf196B1AJZ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf196B1AJZ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf196B1AJZ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf196B1AJZ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf196B1AJZ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf196B1AJZ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf196B1AJZ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf196B1AJZ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf196B1AJZ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1orf196B1AJZ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf196B1AJZ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf196B1AJZ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf196B1AJZ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf196B1AJZ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf196B1AJZ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf196B1AJZ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms