Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
FER1L4A9Z1Z3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
FER1L4A9Z1Z3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
FER1L4A9Z1Z3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
FER1L4A9Z1Z3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
FER1L4A9Z1Z3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
FER1L4A9Z1Z3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
FER1L4A9Z1Z3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
FER1L4A9Z1Z3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
FER1L4A9Z1Z3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
FER1L4A9Z1Z3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
FER1L4A9Z1Z3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
FER1L4A9Z1Z3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
FER1L4A9Z1Z3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
FER1L4A9Z1Z3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
FER1L4A9Z1Z3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
FER1L4A9Z1Z3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
FER1L4A9Z1Z3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
FER1L4A9Z1Z3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
FER1L4A9Z1Z3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
FER1L4A9Z1Z3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
FER1L4A9Z1Z3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
FER1L4A9Z1Z3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
FER1L4A9Z1Z3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
FER1L4A9Z1Z3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
FER1L4A9Z1Z3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
FER1L4A9Z1Z3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
FER1L4A9Z1Z3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
FER1L4A9Z1Z3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
FER1L4A9Z1Z3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
FER1L4A9Z1Z3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
FER1L4A9Z1Z3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
FER1L4A9Z1Z3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
FER1L4A9Z1Z3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
FER1L4A9Z1Z3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
FER1L4A9Z1Z3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
FER1L4A9Z1Z3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
FER1L4A9Z1Z3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.93■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
FER1L4A9Z1Z3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
FER1L4A9Z1Z3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
FER1L4A9Z1Z3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
FER1L4A9Z1Z3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.78■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
FER1L4A9Z1Z3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
FER1L4A9Z1Z3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
FER1L4A9Z1Z3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
FER1L4A9Z1Z3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
FER1L4A9Z1Z3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
FER1L4A9Z1Z3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
FER1L4A9Z1Z3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
FER1L4A9Z1Z3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
FER1L4A9Z1Z3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FER1L4A9Z1Z3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
FER1L4A9Z1Z3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FER1L4A9Z1Z3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FER1L4A9Z1Z3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
FER1L4A9Z1Z3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FER1L4A9Z1Z3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
FER1L4A9Z1Z3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
FER1L4A9Z1Z3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
FER1L4A9Z1Z3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
FER1L4A9Z1Z3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
FER1L4A9Z1Z3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
FER1L4A9Z1Z3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
FER1L4A9Z1Z3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
FER1L4A9Z1Z3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
FER1L4A9Z1Z3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
FER1L4A9Z1Z3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.8 ms