Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACOD1A6NK06 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACOD1A6NK06 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOD1A6NK06 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACOD1A6NK06 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACOD1A6NK06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOD1A6NK06 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOD1A6NK06 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOD1A6NK06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACOD1A6NK06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACOD1A6NK06 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOD1A6NK06 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACOD1A6NK06 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACOD1A6NK06 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOD1A6NK06 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACOD1A6NK06 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACOD1A6NK06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACOD1A6NK06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOD1A6NK06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOD1A6NK06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACOD1A6NK06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACOD1A6NK06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACOD1A6NK06 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACOD1A6NK06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOD1A6NK06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOD1A6NK06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOD1A6NK06 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACOD1A6NK06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOD1A6NK06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms