Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBAL3A6NHL2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBAL3A6NHL2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBAL3A6NHL2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBAL3A6NHL2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBAL3A6NHL2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBAL3A6NHL2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBAL3A6NHL2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBAL3A6NHL2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBAL3A6NHL2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBAL3A6NHL2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBAL3A6NHL2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBAL3A6NHL2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBAL3A6NHL2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBAL3A6NHL2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBAL3A6NHL2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBAL3A6NHL2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBAL3A6NHL2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBAL3A6NHL2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBAL3A6NHL2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBAL3A6NHL2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBAL3A6NHL2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBAL3A6NHL2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBAL3A6NHL2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBAL3A6NHL2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBAL3A6NHL2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBAL3A6NHL2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBAL3A6NHL2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBAL3A6NHL2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBAL3A6NHL2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBAL3A6NHL2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBAL3A6NHL2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBAL3A6NHL2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBAL3A6NHL2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBAL3A6NHL2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBAL3A6NHL2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBAL3A6NHL2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBAL3A6NHL2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBAL3A6NHL2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBAL3A6NHL2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms