Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PABPN1LA6NDY0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PABPN1LA6NDY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PABPN1LA6NDY0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PABPN1LA6NDY0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PABPN1LA6NDY0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PABPN1LA6NDY0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PABPN1LA6NDY0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PABPN1LA6NDY0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPN1LA6NDY0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPN1LA6NDY0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PABPN1LA6NDY0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PABPN1LA6NDY0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PABPN1LA6NDY0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PABPN1LA6NDY0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PABPN1LA6NDY0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PABPN1LA6NDY0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PABPN1LA6NDY0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPN1LA6NDY0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms