Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PSDA5PKW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PSDA5PKW4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PSDA5PKW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PSDA5PKW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PSDA5PKW4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PSDA5PKW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PSDA5PKW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PSDA5PKW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PSDA5PKW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PSDA5PKW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PSDA5PKW4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PSDA5PKW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PSDA5PKW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PSDA5PKW4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PSDA5PKW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PSDA5PKW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PSDA5PKW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PSDA5PKW4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PSDA5PKW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PSDA5PKW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PSDA5PKW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PSDA5PKW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PSDA5PKW4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PSDA5PKW4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PSDA5PKW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PSDA5PKW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PSDA5PKW4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PSDA5PKW4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PSDA5PKW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PSDA5PKW4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PSDA5PKW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PSDA5PKW4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PSDA5PKW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PSDA5PKW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PSDA5PKW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PSDA5PKW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PSDA5PKW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PSDA5PKW4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PSDA5PKW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PSDA5PKW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PSDA5PKW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PSDA5PKW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PSDA5PKW4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PSDA5PKW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PSDA5PKW4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSDA5PKW4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PSDA5PKW4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PSDA5PKW4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PSDA5PKW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PSDA5PKW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PSDA5PKW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PSDA5PKW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PSDA5PKW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PSDA5PKW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PSDA5PKW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PSDA5PKW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PSDA5PKW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PSDA5PKW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PSDA5PKW4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PSDA5PKW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PSDA5PKW4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PSDA5PKW4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PSDA5PKW4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PSDA5PKW4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PSDA5PKW4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PSDA5PKW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PSDA5PKW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PSDA5PKW4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PSDA5PKW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PSDA5PKW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PSDA5PKW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PSDA5PKW4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PSDA5PKW4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PSDA5PKW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PSDA5PKW4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PSDA5PKW4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms